Câu chuyện của ISLAND được thiết lập trên Urashima, một hòn đảo bị cắt đứt khỏi vùng đất chính và bị cô lập bởi 3 gia tộc lớn, vì lí do nào đó. Một ngày nọ, 1 thanh niên có tên Setsuna trôi dạt vào đảo. Setsuna hoàn toàn không có kí ức nào ngoài 2 điều: tên mình và anh được gửi từ tương lai về để giải cứu Urashima. Với sự giúp đỡ của 3 trưởng nữ của các gia tộc, họ cùng nhau tìm cách bảo vệ và làm sáng tỏ những bí ẩn về Urashima.
